一、溫度效應(thermaleffect)：軟組織之切割主要以此效應來達成。若其激光能量撞擊到水分子，則可使水分子激發成為具有高速動能的狀態，此一流體動能便能達到組織切割的良好效果，即是采用水分子作為組織切割之媒介。水分子極易吸收此一波長的激光能量，卻不至于破壞水分子的鍵結結構。
 
二、機械效應(mechanicaleffect)：激光切割加工硬組織的能力不是來自溫度效應，而是藉由能量將組織中的水蒸發(evaporation)，造成組織內壓力(internalpressure)增高，在硬組織熔點未到達之前就造成組織的破裂(rupture)，這個現象特稱之為微爆發
(microexplosion)，和溫度效應無直接相關。

三、流體動力效應(hydrodynamiceffect)：譬如最新的鉺鉻YSGG激光(ErbiumChromium:Yttrium- Scandium-Gallium-Garnetlaser)，主要為激光激發水分子產生高速動力的 流體力學。組織吸收激光能量后溫度會升高，當溫度在370C至600C時組織不會產生變化，一旦超過600C時即開始凝固，可達到止血的效果，當溫度超過1000C，細胞間的水分會被蒸發，剩下脫水的組織超過2000C以上時會被碳化。